Индексацию это никак не тормозит и тормозить не может. А вот на ранжирование в результатах поиска влияет. Поэтому советую настроить ЧПУ, предварительно настроив редирект в файле .htacess
ЧПУ - человеко понятные урлы, то есть адрес страниц выглядит не аброкадаброй как у Вас, а например так: ceram-stroy.ru/catalog/plitka-dlya-vannoy. Включаются чпу скорее всего в админпанели, все зависит от Вашей CMS, а чтобы правильно настроить файл htacess советую обратиться к разработчику магазина. Это необходимо для того, чтобы существующие страницы не потеряли вес и не было битых ссылок на Ваш сайт.