Как сделать подобное, каким плагином

Это функционал непосредственно самой темы, см. http://catcut.net/UF6C

Многие плагины могут реализовать это. Первое, что в голове - это Ad Inserter. Даже в бесплатной версии там много функционала. Плюс есть много плагинов, которые работают через шорт-коды, то есть их можно вставлять именно там, где нужно, хоть в начале статьи, хоть в конце.

В темах реализован такой функционал

https://stylelib.org/root-mnogotselevaya-adaptivnaya-russkaya-tema-wordpress/
https://stylelib.org/reboot/

у меня кстати есть лицензия на тему рут, но там такого функционала я не нашел.

и еще вопрос. Этот рекламный текст размещеный во всех статьях на том сайте. Его поисковики видят? Если да, то это же дубли. По идее этот текст предназначен исключительно для читателей сайта, а от гугла должен быть скрыт

Как вариант, рекламу давать картинкой, а не текстом, ведущей на посадочную страницу с нужным рекламным текстом. Тогда вообще проблем с текстовыми дублями контента не будет.

там же в тексте две ссылки  на описание препарата и на сайт где его можно купить  в этом то вся и идея. к тому же одни и теже картинки на каждой странице сайта, это сигнал поисковикам о веб спаме и дублях. Или я не прав?

С картинками - нет. Тот же логотип подгружается на абсолютно все страницы, к примеру.
В любом случае проблем с плагином для рекламных вставок вообще никакой нет - их много, с разным функционалом. Установите с десяток разных и методом проб выберите для себя самый подходящий. Делов то

Может такой вариант подойдет - http://syblog.ru/kak-vstavit-r...