Канонически - не канонический геморрой.

Нужно указывать абсолютный путь с https протоколом (если есть). (Ссылка нормально не вставляется на pr-cy) на каждой странице такая конструкция. Но вылеты из поиска скорее всего не из за этого - у меня лично была проблема со сменами релевантных страниц. Canonical используется преимущественно для удаления дублей и выбор среди этих дублей нужной страницы (например страницы с параметрами). А вообще тильда это боль.

У меня сайт про производителя, и например есть несколько позиций почти похожие друг на друга, например "мука высший сорт" и "мука первый сорт" , так вот делаешь страницу для  "мука высший сорт" окей она идет вверх в поиске, создаешь страницу "мука первый сорт" и Яндекс теперь понимает , что якобы появился дубль страницы "мука высший сорт" и она падает вниз, а страница "мука первый сорт" её заменят, но так как нет ключей под "мука высший сорт" , то страницы обе падают  вниз. Вот и хрен пойми, как с этой каноничной - не каноничной историей быть ((((

уникализируйте максимально контент страниц - напишите туда тексты, вставьте изображения с alt под ключ и проблема должна решиться. Еще в футер можно ссылочки посадить - мука высший сорт и мука первый сорт - работает тоже неплохо. мета теги тоже уникализировать. Canonical вам здесь не поможет - разве, что выбрать одну страницу, но если нужны 2 в поиске то это не решение.

Нужно две и больше скажу, там не только высший сорт и первый сорт, там куча переплетающегося контента

У сайтов на конструкторах вообще проблемы с индексацией в поисковиках. И с ранжированием тоже.
Так что разумнее слезть с них вообще.

Ты не поверишь, пока не было этой темы с каноническими вопросами, страницы заходили норм. 
Разницы нет , конструктор - не конструктор.
До этого был вордпресс, его вообще не было в поисковике, но это проблема оптимизации.