У меня также на сайте razvitie-baby.ru 2 дня назад пришло уведомление, что на всех страницах исчез canonical. Хотя при просмотре кода никаких изменений не было. В службе поддержки сказали что это сбой в сервисе вебмастера.
Не занимался пока этой проблемой, у моих подопечных все нормально, а просто убивать время для интереса, не вижу смысла, мониторьте тему, что дал ссылку, думаю парни что нибудь накопают или если человек пять обратятся с этой проблемой, тогда и буду заниматься......время - деньги :-)
https://searchengines.guru/showthread.php?t=1003202