Поисковых фраз в 4 раза меньше чем переходов из поисковых систем в ям

Если сайт на WP и шаблон взяли бесплатный, то там вообще такие чудеса могут твориться, что не приведи Господи. А уж если есть поля для комментариев в статьях, да ещё и форум, то аналитике трафик таких сайтов вообще не поддается.
Что касается "накрутки". Думаю нет, если не совсем "плотный" конкурент у вас. Остальным на ваш сайт по барабану :)

Сравни переходы с яндекса в метрике и клики в вебмастере, должны совпадать. Если совпадают - то это вебвизор глючит. У меня на одном сайте поисковые фразы не показываются вообще. Заметил что большинство таких переходов без поисковой фразы - это турбо страницы. Возможно в вебмастере настройка турбо страниц не стоит галочка - вебвизор. А может просто глюкалово. Продвигай под маил ру, бинг и рамблер. Более эффективно получится.

Да, было такое несколько месяцев назад. Это и есть накрутка. Основной признак: время на странице резко просело, у накрученных оно 15 сек. в среднем. Если то же самое, делать что-то нет смысла, Яндекс о проблеме знает и как-то борется, у нас сами отвалились эти переходы со временем. 

В поисковиках ни какой накрутки нет. Поисковиков много, но каждый учитывает только свои поиковые запросы.  Естественно запросов в яндексе будет меньше чем всего пришедших из разных поисковых систем. Поэтому надо смотреть сколько посетителей из какой системы пришло.
А короткие сессии как правило на мобильниках, где инет тупит и страницы плохо грузятся или страница с картинками грузится как турбо и там голый вася — картинок нет и не понятно о чём речь. Поэтому и отказы.