Кто-то начал накручивать сайту траффик, есть ли вред?

не хуже и не лучше, переходы должны быть естественными, системы распознают реальных посетителей, а так же их действия и история посещений, время нахождение и действия на сайте, учитывается процент отказов. Если бы это учитывалось в положительную сторону для поисковиков, то любой ребенок бы накручивал переходы по ссылкам с соц сетей через программу ТОР под разными ИП адресами. Хуже тоже не может быть, так как это было бы легко конкурентам побить Ваш сайт

"Хуже тоже не может быть, так как это было бы легко конкурентам побить Ваш сайт"
Если гугл еще распознает много моментов в этом направлении, то от Яндекса, с его ии - можно ожидать чего угодно.
Стоит пристально наблюдать за этим. Будет не лишним, написать Платонам об этой ситуации. Ничего ценного в ответ не получит, стандартное: "бла-бла-бла, все под контролем, развивайте дальше свой ресурс, подключите турбостраницы, купите у нас рекламу", но заявка уже будет. В случае чего, можно будет ею ткнуть в нос Яндексу.

Согласен

Человек меня опередил. Напишите в поддержку яндекса, как минимум это сделать нужно.
Если переходы с одних и тех же айпи - блокайте по айпи ботов)

Вряд ли в ли.ру было бы уже 40к посетителей) Видимо ботнет хороший, или много ип. Плюс весь трафф русский, что в принципе должно облегчить обнаружение. Но подобное блокировать практически бессмысленно.

да роботы это. Напиши платону и получишь отписку. Посмотри логи и поставь блок. 

Да, отписка обычная. Но их слова о том, что они предусмотрели подобные случаи вызывает ещё больше страха))

ни какой роли не играет, так для "прикола" и "развлечения" :)