Флеш не влияет напрямую на счетчик. Если на сайте чересчур много флеша, то он в первую очередь грузит сайт, время загрузки страницы увеличивается. ноиндекс и нофоллов, как правило, не помешают работе счетчика, если прописаны в нужных местах. У Вас вроде все норм)
счётчик сделал за главным блоком (т.е. пользователи его не видят), может ли это влиять на его работу ??? Вначале всё хорошо работало, потом ничего не менял...
если все хорошо работало, то это скорее всего глюки, бывали подобные проблемы ранее, и не только с Ливинтернетом. не стоит волноваться, скоро попустит)
читал, что чем больше flash контента на сайте, тем больше времени потребуется счётчику чтобы засечь посетителя, поэтому нужно счётчик ставить в самом верху, правда это или нет ???
ноиндекс и нофоллов, как правило, не помешают работе счетчика, если прописаны в нужных местах. У Вас вроде все норм)