Ctr выше 100%

Сайт накручиваете? Скорее всего накручиваете посещения. Может быть неправильно настроена статистика. Или возможно, есть несколько ключевых слов, статистика по которым суммируется некорректно.

Нет, не накручиваю.
Уточнение: CTR 150 и 200% наблюдается по ряду запросов по которым ранжируется статья находящаяся в топе по Яндексу.

Думаю, вам нет смысла переживать. Это  хороший поисковый сигнал. С чем бы ни было связано. Возможно,  к вашей статье обращаются несколько раз за одну поисковую сессию

CTR по своей сути не может быть свыше 100%, скорее всего говорит о том, что пользователь нажимает несколько раз за показ.

Возможно скопирована ссылка вместе с utm-меткой, по которой переходит пользователь. Точного ответа не смогу Вам подсказать. 

Скорее всего глюки, мне выдали тут на днях посещаемость какой не было (смотрел по логам посещений).