Количество внутренних ссылок (если Вы имеете ввиду ТОТ же сайт) - не имеет значения. Очень субъективный параметр, который в моей практике ни разу не сказывался на продвижении сайта и извлечении дохода с рекламы (в том числе - контекстной), хотя внутряков порой переваливало за 100 (на каждой странице). Мое мнение - при прочих равных причину падения во внутренних ссылках не стоит искать