Сайт не работал 1 день

Подсказываю - твой сайт не работал почти день.

и что?

Почти никак. Ну если даже ПС бот в этот день не достучался до вашего сайта, ничего
страшного ( главное чтобы достучался в другой день )

"...мой сайт не работал почти день... Это как-нибудь могло сказаться на поисковых системах?"
Сомневаюсь что сей факт както отразился на ПС)

так в письме было написано работы должны были вестись всего 30 минут...

Угу, но сервер не работал с 3 ночи, до 5 вечера, пока я не перезагрузил VPS. Тех поддержка reg.ru молчит с 8 утра...

У меня похожая ситуация была, только сайт не работал почти 3 дня. 26-28 декабря.
Вылетело из поиска 500 с небольшим страниц (из 6000). За три месяца ни одна страница не вернулась в индекс. Все они были видны в яндекс.вебмастере, как исключенные из-за ошибки. Потом установил яндекс.метрику, за последнии два месяца вернулись в индекс 200 страниц, а оставшиеся 300 еще нет.

Нечего страшного все будет нормально ПС на это не будет реагировать

Максимум, что может быть - это отметка о нерабочем DNS или сервере в Google-вебмастер. Сражу предупрежу ,что это уведомление там будет висеть неделю. Так, что не переживайте.