Как быстро удалить файлы с хостинга через фтп?

FileZilla это и есть FTP, хочешь чтобы было быстро меняй хостинг или своего провайдера

Удалить через тотал быстро. Закачать чуть помедленнее.

через ssh

Закачать архивом и потом распаковать.
А удалить через панель управления. Там можно удалять целыми папками.
Но это не ftp: для этого нужна панель управления с ftp (любая, испманаджер, спанел, директадмин, или хоть самодельная).

Да: и через ssh тоже. Командой.

Total Commander, но только лицензия!
Крякнутой версией вы подвергаете ваш сайт взлому по фтп, новички да-да это вас касается! :-)